FSC® utiliza un sistema de cadena de custodia para supervisar el origen de la materia prima, para garantizar que todos los materiales que se utilizan en una fábrica certificada se obtengan de fuentes legales y creíbles.

Si la gestión forestal también tiene certificación de FSC, es posible utilizar el porcentaje de madera entrante de ese bosque a una fábrica para producir el mismo porcentaje de papel certificado (en un sistema de créditos).